Na Secretaria de Estado da Juventude e Emprego funcionam os seguintes Colectivos:
- Conselho Coordenador;
- Conselho Consultivo;
- Conselho Técnico.
A Secretaria de Estado da Juventude e Emprego tem a seguinte estrutura:
- Inspecção da Juventude e Emprego;
- Direcção Nacional para os Assuntos da Juventude;
- Direcção Nacional de Observação de Emprego;
- Direcção de Planificação e Cooperação;
- Gabinete Jurídico;
- Gabinete do Secretário de Estado;
- Departamento de Administração e Finanças;
- Departamento de Recursos Humanos;
- Departamento de Comunicação, Imagem e Tecnologias de Informação;
- Departamento de Aquisições.